(1)信息安全問題。

信息安全傳輸是指在網絡上傳遞的信息沒有被故意或偶然地非法授權泄漏、更改、破壞或是信息被非法系統(tǒng)辨認、控制，使網絡信息的保密性、完整性、可用性、可控性得到良好的保護狀態(tài)。
 
(2)交易安全問題。

雖然電子商務給企業(yè)帶來了無限的商機，但是沒有安全保障的電子商務交易存在著巨大的風險。在一個開放的網絡平臺上，不誠實的交易對象和黑客攻擊隨時都會威脅到電子商務安全。在B2B的電子商務交易中就存在著欺詐、信息竊取和攔截、信息篡改、抵賴等多方面的威脅。電子商務交易過程需要傳輸許多數據信息，這些數據都涉及到企業(yè)的商業(yè)機密。雖然計算機專家從各個角度開發(fā)了許多電子商務交易的技術保障措施，但仍難保障交易的安全。無論是供貨商還是購買商，仍然對網絡上大量進行商業(yè)活動心存疑慮，因此供銷合同的執(zhí)行、賠償、資金安全、知識產權保護、稅收等使得目前B2B交易有些裹足不前。


 
(3)信用瓶頸。

企業(yè)在交易時會存在如下信用瓶頸:其一，交易達成與否的信用瓶頸，也就是出現“拿貨不給錢”或“拿錢不給貨”的情況；其二，產品與說明一致與否的信用瓶頸；其三，售后服務與承諾一致與否的信用瓶頸。這些問題和多數B2B電子商務平臺對于會員注冊、商品發(fā)布審核、身份認證、合同簽名管理、交易管理等機制的建設不完善有很大關系。
 
(4)缺少安全認證機構。

電子商務認證機構是為了解決電子商務活動中交易各方身份、資信的認定。
 
它是為維護交易活動的安全，從根本上保障電子商務交易活動順利進行而設立的，而且對于增強網上交易各方的信譽，提高網上購物和網上交易的安全、規(guī)避交易風險、推動電子商務的發(fā)展都是必不可少的。
 
(5)相關法律法規(guī)和制度不健全。

由于電子商務是一種“無紙化”的全新貿易方式，它必然需要具有針對性的法規(guī)加以規(guī)范，以保證電子商務這一新興的貿易方式按照其自身的規(guī)律，安全、健康的發(fā)展。其實，我國在與互聯(lián)網相關的立法方面已經取得了很大的進展。特別是自20000年《中華人民共和國電信條例》《互聯(lián)網信息服務管理辦法》互聯(lián)網站從事登載新聞業(yè)務管理暫行規(guī)定》《互聯(lián)網電子公告服務管理規(guī)定》等一系列法規(guī)出臺以來，已為電子商務開展的基礎一互聯(lián)網定制了詳細的規(guī)定。但是，這些集中于網站經營和通信管制方面的法規(guī)和章程，并沒有對在線交易運作環(huán)境和行為做出實質性的規(guī)范。更為重要的是，到目前為止，國家尚未對電子商務發(fā)展拿出一個整體方案和規(guī)劃，更沒有框架性規(guī)范文件出臺，而電子商務發(fā)展的現實求迫使相關政府和部門尋求解決方案和規(guī)范辦法。
 
(6)缺乏有關部門和體制的支持。

目前很多銀行開展了在線支付、電子錢包、數字貨幣、智能卡等支付手段也在發(fā)展中，但中國目前尚無真正的信用制度，所以企業(yè)的異地開戶無法實現，像招行這樣在在線支付領域領先的企業(yè)同樣面臨著網點覆蓋不全的困境，很多偏偏遠地區(qū)的企業(yè)要完成網上交易實屬不易。而且，在解決B2B的過程中，企業(yè)面臨很多操作上的問題，比如銀行的信用證問題、三角債問題，都是制約的因素。圍繞這樣一個不完善的環(huán)境，企業(yè)實施電子商務必然存在一系列企業(yè)即使做電子商務，也是體內循環(huán)體外支付的變通方式。
 
(7)網站優(yōu)化設計的價值還沒有被認識準確。

通過對國內一些主流的B2B電子商務平臺進行對比研究，發(fā)現真正對網站優(yōu)化思想有系統(tǒng)認識的B2B電子商務網站很少，部分網站只是在搜索引擎優(yōu)化方面做了一些基本的工作，有些網站甚至出現了過度優(yōu)化，而遭受搜索引擎懲罰，這些都是對對網站優(yōu)化設計價值的誤解。
 
(8)專業(yè)水平較差。
 
國內B2B網站本身的專業(yè)水平有限，從根本來說，為企業(yè)開展網絡營銷提供應有的價值是B2B電子網站存在和發(fā)展的基礎，而實現這種價值的基礎則是需要B2B網站自身的專業(yè)性，盡管大多數B2B網站的專業(yè)性較差，但少數行業(yè)領先者在各個方面遠遠領先于平均水平，形成了較大反差，對落后者帶來更大的壓力。比如專注于外貿業(yè)B2B平臺的Tradett，專注于原材料采購的阿里巴巴等就遠遠超過了行業(yè)平均水平。
 
(9)平臺功能過于簡單。

在第一次互聯(lián)網經濟浪潮中誕生的眾多B2B電子商務網站，其中有些早已消聲匿跡，也有一些網站仍在艱難運營，這些網站的普遍特點是，網絡營銷思想仍處于2000年前后的免費供求信息發(fā)布時期，電子商務網站實際上為用戶提供的只是供求信息發(fā)布功能，真正的具有“商務”功功能的B2B網站較少，實際上并沒有或者很少具有實質性的電子商務功能。隨著企業(yè)網絡營銷發(fā)展水平的不斷提高，對電子商務平臺提出了更高的要求，然而許多B2B電子商務網站建設仍然處于幾年前的初級階段，網站的功能、結構、內容和服務等基本要素由于專業(yè)水平低下等方面的影響，使得B2B網站的網絡營銷價值難以充分發(fā)揮出來，同時也已經制約了這些B2B網站本身的發(fā)展。